Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms