Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms