Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 2,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scn2aA0A0J9YTW6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Scn2aA0A0J9YTW6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Scn2aA0A0J9YTW6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Scn2aA0A0J9YTW6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Scn2aA0A0J9YTW6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Scn2aA0A0J9YTW6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Scn2aA0A0J9YTW6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Scn2aA0A0J9YTW6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Scn2aA0A0J9YTW6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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