Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H3

Trbv16, T cell receptor beta, variable 16 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv16A0A0B4J1H3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Trbv16A0A0B4J1H3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Trbv16A0A0B4J1H3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Trbv16A0A0B4J1H3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Trbv16A0A0B4J1H3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trbv16A0A0B4J1H3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trbv16A0A0B4J1H3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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