Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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