Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv31A0A075B5J5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv31A0A075B5J5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv31A0A075B5J5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv31A0A075B5J5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv31A0A075B5J5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv31A0A075B5J5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv31A0A075B5J5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Trbv31A0A075B5J5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Trbv31A0A075B5J5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Trbv31A0A075B5J5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Trbv31A0A075B5J5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Trbv31A0A075B5J5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Trbv31A0A075B5J5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Trbv31A0A075B5J5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Trbv31A0A075B5J5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trbv31A0A075B5J5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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