Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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Chmp3Q9CQ10 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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Chmp3Q9CQ10 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm44932-201ENSMUST00000206799 121 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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Chmp3Q9CQ10 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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Chmp3Q9CQ10 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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Chmp3Q9CQ10 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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Chmp3Q9CQ10 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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Chmp3Q9CQ10 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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Chmp3Q9CQ10 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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Chmp3Q9CQ10 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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Chmp3Q9CQ10 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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Chmp3Q9CQ10 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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Chmp3Q9CQ10 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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