Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm23790-201ENSMUST00000083013 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Ubash3bQ8BGG7 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.3 ms