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Protein–RNA interactions for Protein: Q62267
Sprr1b, Cornifin-B, mouse
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153 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Sprr1b
Q62267
Klk1b28-ps-201
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217 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Sprr1b
Q62267
AC117202.2-201
ENSMUST00000226491
1101 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Sprr1b
Q62267
Gm24871-201
ENSMUST00000083099
116 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Sprr1b
Q62267
Gm26066-201
ENSMUST00000083385
109 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Sprr1b
Q62267
n-R5s183-201
ENSMUST00000083939
115 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Sprr1b
Q62267
Gm10217-201
ENSMUST00000088080
135 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Sprr1b
Q62267
Rnu5g-201
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116 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Sprr1b
Q62267
Gm25040-201
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BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Mir18b-201
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83 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm23013-201
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BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm12105-201
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BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm13560-201
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BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Rpl23a-ps9-201
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463 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Rpl23a-ps11-201
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463 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Olfr241-ps1-201
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633 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm44990-201
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217 nt
BASIC
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□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm23056-201
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111 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm24929-201
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BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm22938-201
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BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm13518-201
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233 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm23232-201
ENSMUST00000157300
105 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm21060-201
ENSMUST00000179346
168 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Mir6904-201
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BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm27490-201
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128 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm27639-201
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85 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm43563-201
ENSMUST00000196761
198 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm44487-201
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BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
AC153968.2-201
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1140 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
AC144733.1-201
ENSMUST00000222893
1289 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm24524-201
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BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm22652-201
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131 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm22827-201
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BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm23557-201
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138 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm26501-201
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107 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
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BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
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343 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm45741-201
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152 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
AC124346.1-201
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BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
AC164297.3-201
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BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
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BASIC
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□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Snord60-201
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BASIC
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□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm23239-201
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BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Mir743b-201
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BASIC
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□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Polr2k-ps-201
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BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
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BASIC
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□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
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Sprr1b
Q62267
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BASIC
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Sprr1b
Q62267
Gm23857-201
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BASIC
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Sprr1b
Q62267
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BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm24418-201
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BASIC
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Sprr1b
Q62267
Gm25451-201
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BASIC
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□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm24799-201
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BASIC
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□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm24639-201
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BASIC
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□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm23076-201
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79 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm25077-201
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79 nt
BASIC
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□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm28439-201
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BASIC
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□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm28766-201
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BASIC
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□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
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BASIC
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Sprr1b
Q62267
Olfr1007-ps1-201
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BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
AC125190.3-201
ENSMUST00000223224
121 nt
BASIC
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□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm22229-201
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BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm25431-201
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107 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Trgj3-201
ENSMUST00000103562
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APPRIS P1
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Mir574-201
ENSMUST00000103854
78 nt
BASIC
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□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm24283-201
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107 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm23881-201
ENSMUST00000116872
66 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Mir1899-201
ENSMUST00000122798
96 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm13596-201
ENSMUST00000153354
292 nt
TSL 5
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm23665-201
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62 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm22085-201
ENSMUST00000158344
110 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm22767-201
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BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm22675-201
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BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm20405-201
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229 nt
TSL 5
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm28016-201
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BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm28398-201
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166 nt
TSL 5
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm29653-201
ENSMUST00000187192
166 nt
TSL 5
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm28810-201
ENSMUST00000188173
166 nt
TSL 5
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm28575-201
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166 nt
TSL 5
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm28132-201
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166 nt
TSL 5
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm29580-201
ENSMUST00000189921
166 nt
TSL 5
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm28858-201
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166 nt
TSL 5
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm28210-201
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166 nt
TSL 5
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm28336-201
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166 nt
TSL 5
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm29042-201
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166 nt
TSL 5
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm37998-201
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166 nt
TSL 5
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm43470-202
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227 nt
TSL 3
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
AC154248.2-201
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659 nt
TSL 5
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm23404-201
ENSMUST00000082543
97 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm22489-201
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62 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Mir1951-201
ENSMUST00000157981
89 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm26022-201
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108 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm10177-202
ENSMUST00000161698
207 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm20417-201
ENSMUST00000174784
425 nt
TSL 5
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm26233-201
ENSMUST00000175530
70 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm25284-201
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141 nt
BASIC
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□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Topbp1-ps2-201
ENSMUST00000191289
189 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm9227-201
ENSMUST00000194733
566 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm42805-201
ENSMUST00000196158
276 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm43140-201
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456 nt
TSL 2
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
Sprr1b
Q62267
Gm26002-201
ENSMUST00000101915
107 nt
BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
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