Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Sh3bp1P55194 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Sh3bp1P55194 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms