Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd9P28357 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm25847-201ENSMUST00000116793 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 mt-Tl2-201ENSMUST00000082417 71 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm22458-201ENSMUST00000082576 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm25705-201ENSMUST00000083119 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd9P28357 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
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