Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm23735-201ENSMUST00000082551 134 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccl20O89093 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccl20O89093 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms