RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: O35054
Cldn4, Claudin-4, mouse
Predictions only
Length
210 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Cldn4
O35054
Gm22842-201
ENSMUST00000157709
118 nt
BASIC
1.55
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Gm22557-201
ENSMUST00000157804
102 nt
BASIC
1.55
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Gm25464-201
ENSMUST00000175481
107 nt
BASIC
1.55
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Mir7665-201
ENSMUST00000184907
63 nt
BASIC
1.55
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
AC139186.1-201
ENSMUST00000197610
94 nt
BASIC
1.55
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Olfr1098-202
ENSMUST00000111574
2885 nt
APPRIS P1
TSL 3
BASIC
1.55
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Vmn1r-ps120-201
ENSMUST00000120288
377 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Gm25884-201
ENSMUST00000157782
62 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Gm23113-201
ENSMUST00000158477
99 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Gm24106-201
ENSMUST00000175498
127 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Gm44325-201
ENSMUST00000196757
77 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Gm44384-201
ENSMUST00000200208
114 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Gm44921-201
ENSMUST00000205290
301 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Gm44922-201
ENSMUST00000206690
90 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Gm35309-201
ENSMUST00000208337
478 nt
TSL 3
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
AC160863.1-201
ENSMUST00000218412
317 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Gm23100-201
ENSMUST00000083455
141 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Gm25627-201
ENSMUST00000084003
153 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Traj52-201
ENSMUST00000103691
66 nt
APPRIS P1
BASIC
1.53
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Gm6952-201
ENSMUST00000118629
159 nt
BASIC
1.53
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Gm22477-201
ENSMUST00000122569
316 nt
BASIC
1.53
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Gm15391-201
ENSMUST00000147509
257 nt
TSL 3
BASIC
1.53
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Gm23122-201
ENSMUST00000157645
103 nt
BASIC
1.53
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Gm25035-201
ENSMUST00000175414
77 nt
BASIC
1.53
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Mir6350-201
ENSMUST00000183639
105 nt
BASIC
1.53
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Mir6419-201
ENSMUST00000184784
113 nt
BASIC
1.53
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
1700016B01Rik-201
ENSMUST00000197688
270 nt
TSL 1 (best)
BASIC
1.53
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Gm44177-201
ENSMUST00000204338
2667 nt
BASIC
1.53
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
CT485608.2-201
ENSMUST00000227210
291 nt
BASIC
1.53
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Snora3-201
ENSMUST00000083082
132 nt
BASIC
1.53
□□□□□ -2.16
Cldn4
O35054
Olfr790-203
ENSMUST00000215067
2659 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
1.53
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
AC159625.1-201
ENSMUST00000220994
2625 nt
BASIC
1.53
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Igkv4-63-201
ENSMUST00000103351
286 nt
APPRIS P1
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Rpl30-ps5-201
ENSMUST00000117104
361 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Fau-ps1-201
ENSMUST00000119675
252 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm25323-201
ENSMUST00000122555
103 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm23656-201
ENSMUST00000122626
112 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm12869-201
ENSMUST00000156265
344 nt
TSL 2
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm26412-201
ENSMUST00000157666
55 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm23898-201
ENSMUST00000158111
103 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm25716-201
ENSMUST00000158628
104 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Mir3057-201
ENSMUST00000175040
91 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm22286-201
ENSMUST00000179708
107 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm38364-201
ENSMUST00000191814
179 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm43749-201
ENSMUST00000199345
352 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm45489-201
ENSMUST00000211753
443 nt
TSL 3
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm24406-201
ENSMUST00000083026
128 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm24261-201
ENSMUST00000083744
104 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
AC164629.4-201
ENSMUST00000218505
3247 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Mir223-201
ENSMUST00000102112
110 nt
BASIC
1.51
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm25828-201
ENSMUST00000157087
95 nt
BASIC
1.51
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm26097-201
ENSMUST00000179642
93 nt
BASIC
1.51
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Mir21b-201
ENSMUST00000184317
108 nt
BASIC
1.51
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm22850-201
ENSMUST00000157714
82 nt
BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm22386-201
ENSMUST00000158192
129 nt
BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
AC164612.2-202
ENSMUST00000216314
253 nt
BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
AC192091.2-201
ENSMUST00000217869
117 nt
BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
AC154282.1-201
ENSMUST00000223154
265 nt
BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm25081-201
ENSMUST00000082534
108 nt
BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Mir34a-201
ENSMUST00000083559
102 nt
BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Zfp981-203
ENSMUST00000179175
2953 nt
APPRIS P1
TSL 2
BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm22148-201
ENSMUST00000104445
107 nt
BASIC
1.49
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm16225-201
ENSMUST00000146152
276 nt
TSL 5
BASIC
1.49
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm22967-201
ENSMUST00000157956
239 nt
BASIC
1.49
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm24001-201
ENSMUST00000158463
85 nt
BASIC
1.49
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm28537-201
ENSMUST00000189026
315 nt
BASIC
1.49
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm29631-201
ENSMUST00000191065
315 nt
BASIC
1.49
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm9251-201
ENSMUST00000197202
628 nt
BASIC
1.49
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm42623-201
ENSMUST00000197225
379 nt
BASIC
1.49
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Mir488-201
ENSMUST00000093595
109 nt
BASIC
1.49
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Olfr730-202
ENSMUST00000205837
4903 nt
APPRIS ALT1
BASIC
1.49
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Olfr1222-203
ENSMUST00000215816
3796 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
1.48
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Vmn1r78-203
ENSMUST00000228664
8100 nt
APPRIS P1
BASIC
1.48
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Traj26-201
ENSMUST00000103715
60 nt
APPRIS P1
BASIC
1.48
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm26049-201
ENSMUST00000157313
108 nt
BASIC
1.48
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm22228-201
ENSMUST00000157364
101 nt
BASIC
1.48
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm25882-201
ENSMUST00000157784
85 nt
BASIC
1.48
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm22606-201
ENSMUST00000158290
103 nt
BASIC
1.48
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Mir1966-201
ENSMUST00000158807
108 nt
BASIC
1.48
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm17215-201
ENSMUST00000170074
277 nt
TSL 3
BASIC
1.48
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm27248-201
ENSMUST00000184004
166 nt
BASIC
1.48
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm44338-201
ENSMUST00000198614
110 nt
BASIC
1.48
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
AC129085.1-201
ENSMUST00000225263
165 nt
BASIC
1.48
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm22743-201
ENSMUST00000083445
133 nt
BASIC
1.48
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Mir221-201
ENSMUST00000083488
95 nt
BASIC
1.48
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm23578-201
ENSMUST00000103943
104 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Mir1298-201
ENSMUST00000116681
98 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm13246-201
ENSMUST00000120994
315 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm24379-201
ENSMUST00000122695
86 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Scarna3b-201
ENSMUST00000157533
139 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm22082-201
ENSMUST00000157587
161 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm26403-201
ENSMUST00000158500
105 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm24634-201
ENSMUST00000158672
107 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm26360-201
ENSMUST00000158872
103 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Mir3098-201
ENSMUST00000175416
87 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm28669-201
ENSMUST00000188400
100 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Ighv15-1-201
ENSMUST00000194450
276 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
1700014F14Rik-201
ENSMUST00000199566
197 nt
TSL 1 (best)
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm43911-201
ENSMUST00000203097
76 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
AC150901.1-201
ENSMUST00000208407
145 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
First
Previous
749
Next
Last
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.5 ms