Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
H2-Q1O19441 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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H2-Q1O19441 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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H2-Q1O19441 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
H2-Q1O19441 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
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