Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cldn34c2J3QNM1 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 488.1 ms