Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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Chmp3Q9CQ10 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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Chmp3Q9CQ10 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
Chmp3Q9CQ10 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
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Chmp3Q9CQ10 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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