Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Usp38Q8BW70 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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