Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Chsy1Q6ZQ11 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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