Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Cpne9Q1RLL3 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Cpne9Q1RLL3 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Cpne9Q1RLL3 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cpne9Q1RLL3 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cpne9Q1RLL3 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cpne9Q1RLL3 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cpne9Q1RLL3 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cpne9Q1RLL3 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cpne9Q1RLL3 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cpne9Q1RLL3 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Cpne9Q1RLL3 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cpne9Q1RLL3 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Cpne9Q1RLL3 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Cpne9Q1RLL3 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Cpne9Q1RLL3 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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