Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ggta1P23336 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ggta1P23336 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ggta1P23336 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ggta1P23336 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ggta1P23336 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
Ggta1P23336 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ggta1P23336 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ggta1P23336 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ggta1P23336 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ggta1P23336 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ggta1P23336 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ggta1P23336 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC0.09□□□□□ -2.4
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Ggta1P23336 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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Ggta1P23336 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
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Ggta1P23336 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Ggta1P23336 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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Ggta1P23336 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
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Ggta1P23336 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
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Ggta1P23336 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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Ggta1P23336 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ggta1P23336 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ggta1P23336 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ggta1P23336 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ggta1P23336 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ggta1P23336 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ggta1P23336 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ggta1P23336 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ggta1P23336 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ggta1P23336 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ggta1P23336 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ggta1P23336 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ggta1P23336 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ggta1P23336 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ggta1P23336 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ggta1P23336 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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