Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
P10404 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
P10404 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
P10404 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
P10404 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
P10404 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
P10404 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
P10404 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
P10404 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
P10404 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
P10404 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
P10404 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
P10404 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
P10404 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
P10404 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
P10404 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
P10404 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
P10404 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
P10404 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
P10404 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
P10404 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
P10404 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
P10404 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
P10404 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
P10404 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
P10404 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
P10404 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
P10404 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
P10404 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
P10404 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
P10404 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
P10404 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
P10404 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
P10404 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
P10404 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
P10404 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
P10404 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
P10404 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
P10404 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
P10404 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
P10404 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
P10404 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
P10404 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
P10404 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
P10404 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
P10404 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
P10404 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
P10404 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
P10404 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
P10404 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
P10404 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
P10404 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
P10404 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
P10404 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
P10404 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
P10404 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
P10404 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
P10404 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
P10404 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
P10404 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
P10404 Gm25681-201ENSMUST00000083938 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
P10404 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
P10404 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
P10404 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
P10404 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
P10404 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
P10404 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
P10404 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
P10404 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
P10404 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
P10404 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
P10404 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
P10404 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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