Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn4O35054 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn4O35054 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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