Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm23974-201ENSMUST00000083321 131 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm24806-201ENSMUST00000117036 90 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm19248-201ENSMUST00000209404 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm24612-201ENSMUST00000083267 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Mir485-201ENSMUST00000093620 73 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm23166-201ENSMUST00000157164 101 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm25225-201ENSMUST00000158197 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm22157-201ENSMUST00000158410 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm25186-201ENSMUST00000083909 108 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm24377-201ENSMUST00000104398 131 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm22401-201ENSMUST00000174927 117 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Usp9yF8VPU6 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm26262-201ENSMUST00000158024 127 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm22402-201ENSMUST00000174920 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Mir29b-1-201ENSMUST00000083670 71 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm24185-201ENSMUST00000122578 105 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm26122-201ENSMUST00000083362 82 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Usp9yF8VPU6 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.2 ms