Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccdc171E9Q1U1 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccdc171E9Q1U1 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ccdc171E9Q1U1 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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Ccdc171E9Q1U1 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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Ccdc171E9Q1U1 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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Ccdc171E9Q1U1 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc171E9Q1U1 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
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Ccdc171E9Q1U1 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
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Ccdc171E9Q1U1 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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Ccdc171E9Q1U1 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc171E9Q1U1 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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Ccdc171E9Q1U1 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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Ccdc171E9Q1U1 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc171E9Q1U1 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc171E9Q1U1 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc171E9Q1U1 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc171E9Q1U1 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc171E9Q1U1 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc171E9Q1U1 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc171E9Q1U1 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc171E9Q1U1 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
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