Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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Gpc1Q9QZF2 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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Gpc1Q9QZF2 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Gpc1Q9QZF2 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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Gpc1Q9QZF2 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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Gpc1Q9QZF2 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Gpc1Q9QZF2 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Gpc1Q9QZF2 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gpc1Q9QZF2 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Gpc1Q9QZF2 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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Gpc1Q9QZF2 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gpc1Q9QZF2 Gm25696-201ENSMUST00000082900 105 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gpc1Q9QZF2 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gpc1Q9QZF2 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Gpc1Q9QZF2 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
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