Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm24027-201ENSMUST00000177611 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm23560-201ENSMUST00000177782 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm25462-201ENSMUST00000177833 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm26059-201ENSMUST00000177865 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm22255-201ENSMUST00000177933 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm25146-201ENSMUST00000177976 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm25523-201ENSMUST00000178044 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm24585-201ENSMUST00000178104 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm22627-201ENSMUST00000178127 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm22912-201ENSMUST00000178242 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm24866-201ENSMUST00000178338 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm22524-201ENSMUST00000178357 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm25710-201ENSMUST00000178367 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm23575-201ENSMUST00000178406 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm24872-201ENSMUST00000178434 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm22449-201ENSMUST00000178924 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm24702-201ENSMUST00000178965 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm24206-201ENSMUST00000179011 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm24528-201ENSMUST00000179164 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm22909-201ENSMUST00000179190 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm26334-201ENSMUST00000179403 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm25463-201ENSMUST00000179405 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm25742-201ENSMUST00000179530 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm25209-201ENSMUST00000179576 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm26392-201ENSMUST00000179661 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm25230-201ENSMUST00000179740 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm26434-201ENSMUST00000179778 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm25741-201ENSMUST00000179825 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm24759-201ENSMUST00000179827 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm24219-201ENSMUST00000179861 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm23254-201ENSMUST00000097244 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rabgef1Q9JM13 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136 ms