Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Usp29Q9ES63 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Usp29Q9ES63 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms