Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms