Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm27935-201ENSMUST00000183894 79 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm26043-201ENSMUST00000116912 91 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm23199-201ENSMUST00000158812 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm23421-201ENSMUST00000158934 104 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Mir677-202ENSMUST00000197076 78 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Mirlet7a-2-201ENSMUST00000175029 96 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
Ccdc18Q640L5 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC-1.98□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC-1.99□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Mir7086-201ENSMUST00000183683 65 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC-2□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Mir302c-201ENSMUST00000083548 68 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Traj29-201ENSMUST00000103712 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.01□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC-2.01□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm25137-201ENSMUST00000083251 110 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 AC167019.1-201ENSMUST00000227913 106 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm22157-201ENSMUST00000158410 104 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Ccdc18Q640L5 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
Ccdc18Q640L5 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms