Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 mt-Tf-201ENSMUST00000082387 68 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cntn3Q07409 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Cntn3Q07409 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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