Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd1Q01822 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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