Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Hoxd10P28359 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Hoxd10P28359 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Hoxd10P28359 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Hoxd10P28359 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Hoxd10P28359 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Hoxd10P28359 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Hoxd10P28359 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Hoxd10P28359 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Hoxd10P28359 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Hoxd10P28359 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd10P28359 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms