Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 AC140930.2-201ENSMUST00000221803 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm23293-201ENSMUST00000082552 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm24674-201ENSMUST00000179194 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd9P28357 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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