Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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Ccl20O89093 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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Ccl20O89093 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccl20O89093 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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