Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
H2-Q1O19441 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
H2-Q1O19441 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.6 ms