Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Gm3893E9Q1I1 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC2□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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Gm3893E9Q1I1 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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Gm3893E9Q1I1 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm3893E9Q1I1 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Gm3893E9Q1I1 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.1 ms