Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm23817-201ENSMUST00000158449 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Uhrf1Q8VDF2 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.2 ms