Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
Pggt1bQ8BUY9 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Pggt1bQ8BUY9 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Pggt1bQ8BUY9 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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