Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vipas39Q8BGQ1 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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