Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Chsy1Q6ZQ11 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms