Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Spatc1Q148B6 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
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Spatc1Q148B6 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
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Spatc1Q148B6 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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Spatc1Q148B6 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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Spatc1Q148B6 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
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Spatc1Q148B6 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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Spatc1Q148B6 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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Spatc1Q148B6 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
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Spatc1Q148B6 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Spatc1Q148B6 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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