Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sh3bp1P55194 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Sh3bp1P55194 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Sh3bp1P55194 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Sh3bp1P55194 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Sh3bp1P55194 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Sh3bp1P55194 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Sh3bp1P55194 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Sh3bp1P55194 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms