Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Mir1187-201ENSMUST00000116936 122 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Mir1950-201ENSMUST00000158526 74 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm23261-201ENSMUST00000158316 136 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm25449-201ENSMUST00000179389 79 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm26109-201ENSMUST00000083970 70 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd9P28357 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 AC132833.2-201ENSMUST00000228699 157 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Hoxd9P28357 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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