Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccl20O89093 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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Ccl20O89093 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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Ccl20O89093 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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Ccl20O89093 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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Ccl20O89093 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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Ccl20O89093 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccl20O89093 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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