Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn34c2J3QNM1 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn34c2J3QNM1 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn34c2J3QNM1 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms