Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Ccdc171E9Q1U1 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
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