Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc6D3YZP9 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc6D3YZP9 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc6D3YZP9 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc6D3YZP9 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc6D3YZP9 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc6D3YZP9 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc6D3YZP9 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc6D3YZP9 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc6D3YZP9 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.4 ms