Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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