Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 mt-Tf-201ENSMUST00000082387 68 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.5 ms