Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Wdr61Q9ERF3 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Wdr61Q9ERF3 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
Wdr61Q9ERF3 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Wdr61Q9ERF3 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Wdr61Q9ERF3 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Wdr61Q9ERF3 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Wdr61Q9ERF3 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
Wdr61Q9ERF3 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Wdr61Q9ERF3 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Wdr61Q9ERF3 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC0.09□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Wdr61Q9ERF3 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Wdr61Q9ERF3 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Wdr61Q9ERF3 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Wdr61Q9ERF3 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Wdr61Q9ERF3 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Wdr61Q9ERF3 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Wdr61Q9ERF3 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Wdr61Q9ERF3 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Wdr61Q9ERF3 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Wdr61Q9ERF3 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Wdr61Q9ERF3 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Wdr61Q9ERF3 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
Wdr61Q9ERF3 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
Wdr61Q9ERF3 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
Wdr61Q9ERF3 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Wdr61Q9ERF3 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Wdr61Q9ERF3 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Wdr61Q9ERF3 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms